Informe de Microbiota Intestinal

Esta guía se ha elaborado para dar unas orientaciones para la interpretación del informe del Estudio Metagenómico de la Microbiota Intestinal de Xenogene.

Para ello se han separado y detallado varios apartados del informe para la comprensión global del estudio. Se recomienda hacer una revisión del resumen para tener una idea del estado global de los resultados y entrar en detalle dónde sea requerido.

El informe comienza con la portada, contraportada y datos del paciente. Inmediatamente después, está en índice del informe y, a continuación, el resumen.

El resumen consta de varios apartados que debemos enumerar y detallar:

Parámetros:

- ADN humano: es el % de ADN humano presente en la muestra. Niveles alto de ADN humano en la muestra puede significar que hay un proceso inflamatorio, descamación del epitelio intestinal o incluso sangrado. Se recomienda pruebas adicionales como la prueba de sangre oculta en heces para descartar conocer el origen de esta presencia excesiva en la muestra.

- Contenido Bacteriano: es el % de la muestra que representan las BACTERIAS. El resto de porcentaje es la suma del resto de ADN presente en la muestra, que proviene principalmente de los alimentos, de otros organismos presentes en la muestra (Parásitos, Aqueas, Virus o de organismos ambientales).

Nota aclaratoria: a partir de este punto, los porcentajes bacterianos son relativos al porcentaje de bacterias total de la muestra.

Filos Principales Encontrados:

Se exponen los % de los distintos Filos Bacterianos detectados en la muestra. Junto a los %, aparece los rangos de referencia en los que deben encontrar cada Filo y una valoración según su porcentaje según el rango de referencia. También, sigue una gráfica de tarta con la representación de cada filo. Aquí obtenemos una visión global de los filos presentes, lo que nos puede ayudar a intuir el origen de determinadas sintomatologías, así como el tipo de dieta que lleva el paciente.

Datos de biodiversidad bacteriana:

- Número de Filos bacterianos

- Número de Familia bacterianas

- Número de Géneros bacterianos

- Número de Especies bacterianas

- Numero de Subespecies/Cepas bacterianas

En este apartado se hace una clasificación según los distintos niveles taxonómicos de las bacterias encontradas en la muestra. Esto puede dar idea de la diversidad bacteriana que existe y de la complejidad del ecosistema que tenemos en el intestino. Por lo general, a mayor número de especies bacterianas, mayor diversidad, lo que significa que más especies bacterianas distintas podrán cubrir la misma función, contribuyendo con el mantenimiento de la homeostasis. Es un factor a tener en cuenta ya que la aproximación que debamos darle al tratamiento dependerá de si la diversidad favorece una función positiva o negativa.

La disbiosis en el intestino puede ser debida principalmente por 3 formas de reducción de diversidad: - Disminución de bacterias beneficiosas - Aumento de las Bacterias causantes de enfermedades - Reducción inducida de la diversidad de especies bacteriana (i.e. usos de antibióticos)

Con estos datos expuestos, se pueden calcular algunos índices de diversidad que en principio se podría corregir en cierta medida con una modificación supervisada de la dieta, usos de probióticos, prebióticos o suplementos.

Para el estudio de la diversidad de la microbiota intestinal, históricamente se han usado unos índices básicos que aportan cierta información.

índices de diversidad microbiana

- Índice Firmicutes/Bacteroidetes: es un índice que relaciona los dos filos más abundantes de la Microbiota Intestinal. Se relaciona con la obesidad, con el tipo de dieta, podría apuntar a la enfermedad inflamatoria intestinal, diabetes entre otras enfermedades.

- Índice Firmicutes+Bacteroides: Es un índice que muestra la dominancia de los dos filos más abundantes frente al resto de los Filos presentes. La suma de estos dos filos puede representar el 85% en los casos normales. Si se encuentra por debajo de este nivel, es indicativo de disbiosis pues significaría el sobrecrecimiento de otro filo minoritario.

- Índice Bacteroides/Prevotella: Es un índice que muestra un equilibrio entre dos géneros que pertenecen al mismo filo. En líneas generales, una proporción mayor de Bacteroides se asocia a un estilo de vida occidental, mientras que una mayor proporción de Prevotellas se asocia a un estilo de vida no occidental. Se sugiere que la diferencia entre ambas dietas es la proporción entre la fibra alimentaria compleja y las proteínas en la dieta.

Una vez revisado el resumen inicial y los parámetros de diversidad, pasamos a la valoración global de los diferentes grupos funcionales. Aparecen dos páginas que reflejan la valoración de cada grupo funcional en función de si está Bajo, Normal, Moderado, Alto o Alterado comparando el porcentaje total ([%], primera columna) con respecto al de referencia (segunda columna).

Porcentaje de cada grupo funcional acompañado del rango óptimo de referencia y la valoración.

A la hora de realizar la valoración hay excepciones. Puede ocurrir que el porcentaje total de un grupo esté dentro de los valores normales, pero se valore como alterado/moderado/bajo. Esto puede deberse a varios motivos:

- A pesar de que el porcentaje total de ese grupo funcional se encuentre dentro del rango de referencia, un reducido número de bacterias representa más del 40 % de esa microbiota (indica que la diversidad bacteriana está reducida).

- Faltan algunas especies consideradas fundamentales.

- Existen bacterias cuya abundancia es 10 veces superior a la de referencia, aunque no lleguen al 40% de esa microbiota (Ejemplo en la Figura 4).